Sim. Desde o Vestibular 2018 a Unifesp oferece reserva de vagas para pessoas com deficiência. A modalidade foi criada para atender à Lei n.º 13.409/2016, de 29 de dezembro de 2016. O texto alterou a legislação que instituiu as cotas no ensino superior federal (Lei n.º 12.711/2012).

Cumpre obsevar, na Unifesp,  que as vagas disponíveis para Pessoas com Deficiência (PcD), são aquelas descritas na Lei 12711/2012.